La estación de control (GCS) del FT-ALTEA está formada por un conjunto de equipos y sistemas que asumen las tareas de planificación y control de la misión (control de vuelo, control de la carga útil) , distribución o diseminado de la información a usuarios exteriores o finales, comunicaciones con la torre de control asignada.
La estación de tierra incluye sistemas de comunicaciones y enlaces de datos necesarios para acceder a la plataforma y a los sistemas embarcados. Estos controles son necesarios para, al menos, definir y supervisar la misión. El GCS consta del equipo físico y de los medios humanos que dirigen y controlan la misión desde la estación base. Puede estar situada en tierra, mar o aire y puede estar en un emplazamiento fijo o en una unidad móvil.
Planificación de la misión. La misión se constituye fundamentalmente por la definición del plan de vuelo a seguir y por las acciones que debe ejecutar.
Comunicación con el UAV. Para transmitir las órdenes y recibir la telemetría, con datos de velocidad, altura y posición, se usan antenas direccionales y omnidireccionales con radio módems redundantes.
Carga de pago o carga útil. La carga útil está integrada por cámaras de visión electro óptica y visión infrarroja o térmica, también puede incluir sensores de temperatura, humedad, CO2, cámaras hiper-espectrales y otros sensores. Los sensores y sistemas de a bordo pueden recolectar gran cantidad de información y enviarla en tiempo real a la estación.
La misión la ejecuta el sistema de control de vuelo autónomo. Hay que tener en cuenta que, aunque el UAV vuele de forma autónoma, siempre es posible tomar el control del mismo desde la estación de control (GCS).